Por tierra:
Puerto Morelos se ubica en el extremo Norte del estado de Q. Roo. En el km 31 de la carretera 307 Pto. Juárez-Chetumal.
Desde Cancún, tomar la carretera rumbo a Playa del Carmen (Carretera 107 Puerto Juárez-Chetumal). En el kilómetro 31 dar vuelta a la izquierda, rumbo al mar. Esa es la entrada a Puerto Morelos. El recorrido de Cancún a Puerto Morelos en automóvil se realiza en aproximadamente 20 minutos.
Por aire:
El Aeropuerto Internacional de Cancún está a 18 km (20 min.) de distancia. Salen y llegan vuelos de las principales ciudades de Estados Unidos, y algunas capitales europeas.
El Aeropuerto Internacional de Cancún recibe diariamente más de 80 vuelos procedentes de la Ciudad de México (1 hora con 45 minutos, aproximadamente) y de algunas de las principales ciudades de los Estados Unidos, como Nueva York (4 horas de vuelo, aproximadamente) o Miami (1 hora con 30 minutos, aproximadamente).
El aeropuerto cuenta con dos terminales, uno para vuelos comerciales y el otro para charters. Se encuentra a la altura del kilómetro 22 de la carretera Cancún-Chetumal, a casi 10 kilómetros de la Zona Hotelera, distancia que se cubre en 15 ó 20 minutos, en auto.